Las actividades docentes se nucleán dentro de cuatro Escuelas: de Agronomía, de Alimentos, de Biotecnología y de Química.
El Consejo Directivo de FAyA, por Res CDFAA 219-2024, da por electos a los siguientes Directores de Departamentos Académicos.
Departamentos
Ciencias Básicas
a cargo Lic. Enrique Biasoni
Ciencias Biológicas Aplicadas
a cargo Ing. Cristian Gastón Maldonado
Ciencias Químicas Aplicadas
a cargo Dra. Gisela Lucia Fabiani
Ciencias Sociales y Humanas
a cargo Dr. José Eduardo Galiano
Producción Agropecuaria
a cargo Ing. María del Carmen Ochoa
Ingeniería de Procesos
a cargo Dra. Miriam Teresa Nediani